种子进行休眠是因为种胚不成熟、种被的障碍、抑制物存在、条件不适宜，种子虽然已经成熟，但是种胚没有生长成熟，此时脱离了母株的话，仍然需要从胚乳里面吸收营养，从而达到成熟的状态，这也就是后熟休眠。如果说种子的种皮透气和透水性受到约束，或种子表面有蜡状物，这样就会抑制水分进入到种子。有的种子含水量很高，气体还是很难进入，种子内部所产生的二氧化碳不容易排出去，就影响种胚的发育，这样也会使种子进入到休眠的状态。

种子休眠的原因

有的种子果皮、胚乳、胚部含有抑制物发芽的物质，比如芳香油类、氧化氢或是有机酸类等，物质就会影响种子萌发，进而出现休眠。生长条件不适合萌发，在适宜的环境下种子是可以萌发的，环境不利这种情况也就是二次休眠。

种子休眠对于植物本身是有利的，长期自然选择种形成的抵抗不良环境条件的适应性，这样对种子的延续有利。农业生产意义：种子休眠可以防止穗发芽，对于种子储藏十分有利，而且还有后熟作用，可以提高产量，有的种子是在夏秋季产生的，若在冬季前发芽，就容易冻死。